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1. ⭐ 冯若轻/刘璐等Immunity：通过单细胞空间转录组发现多发性硬化病灶的致病性炎症免疫细胞微环境

• ✍️ 作者：CellPress全科学
• 🏷️ 关键词：单细胞、空间转录组、转录组
• 📝 描述：该研究在人类慢性活动性病灶中描绘出单细胞分辨率的空间图谱。
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2. 10月最新纯生信，聚焦星级热点神经-肿瘤互作的多组学泛癌分析，快来欣赏一下！

• ✍️ 作者：东晓生物
• 🏷️ 关键词：肿瘤、生信
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3. Cancer Cellf发表：感官神经元通过谷氨酸能神经元 - 癌症伪突触驱动胰腺癌进展

• ✍️ 作者：生信小课堂
• 🏷️ 关键词：癌症、cancer
• 📝 描述：最新Cancer Cell重磅，胰腺癌中首次证实神经元与癌细胞间存在 “神经元-癌细胞假性突触”，并形成正反馈增强肿瘤神经浸润！
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4. 综述 | TrendsCancer | 拥抱多样性：癌症中巨噬细胞的复杂性

• ✍️ 作者：BioJournal Link
• 🏷️ 关键词：癌症、cancer
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5. 空间聚类分析之cellcharter

• ✍️ 作者：生信菜鸟团
• 🏷️ 关键词：聚类
• 📝 描述：本期将继续带大家了解另一款发表在 Nature Genetics 上的高分空间聚类算法CellCharter。
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6. Nat Methods| Nicheformer：把“空间微环境”装进单细胞的大模型里

• ✍️ 作者：生信小博士
• 🏷️ 关键词：单细胞
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7. 简化GWAS流程！SNPRelate包，遗传信息的精准翻译官！

• ✍️ 作者：云生信
• 🏷️ 关键词：R包
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8. 能把这篇Nature的单细胞代码学明白，免疫细胞的分析以后就不愁了

• ✍️ 作者：生信钱同学
• 🏷️ 关键词：单细胞
• 📝 描述：单细胞代码经典文章
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1. ⭐ GSE306909 Enhancer Remodeling-Driven Mevalonate Pathway Confers Resistance to KRAS Inhibitor in Colorectal Cancer

• ✍️ 作者：未知作者
• 🏷️ 关键词：cancer、Hi-C、single.cell、scRNA、scDNA、scATAC、spatial、genome、genomics、Scanpy、histone、pathway
• 📝 描述：Contributors : Yaoyu Guo ; J TanSeries Type : Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing ; Expression profiling by high throughput sequencingOrganism : Homo sapiensThis study investigates the resistance mechanisms to pan-KRAS inhibitors in colorectal cancer (CRC). We established a panel of patient-derived organoids (PDOs) and cell lines with differential sensitivity to pan-KRAS inhibitors. Integrated epigenomic (ChIP-seq for H3K27ac and H3K4me3) and transcriptomic (RNA-seq)…
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2. ⭐ GSE309058 An isodecoder‑resolved map of mouse tRNAs, tRNA‑derived small RNAs, and RNA modification signatures across 19 tissues

• ✍️ 作者：未知作者
• 🏷️ 关键词：cancer、scRNA、scDNA、scATAC、spatial、genome、genomics、Seurat、clustering
• 📝 描述：Contributors : Aidan C Manning ; Todd M Lowe ; Patricia P ChanSeries Type : Non-coding RNA profiling by high throughput sequencingOrganism : Mus musculusTransfer RNAs (tRNAs) and their derived small RNAs (tDRs) vary across mammalian tissues, but the . We applied Ordered Two-Template Relay sequencing (OTTR-seq) to profile small RNAs in 19 tissues from adult mice, quantifying mature tRNAs and tDRs at isodecoder resolution and inferring select base‑modification signatures from reverse‑transcriptase…
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1. 癌症中细胞死亡免疫串扰的治疗靶向以重新连接肿瘤免疫微环境

• ✍️ 作者：未知作者
• 🏷️ 关键词：肿瘤、癌症
• 📝 描述：Secret hovertext: 免疫系统通过协调抑制恶性肿瘤的发生、进展和转移的抗肿瘤反应，在抗癌防御中发挥核心作用。新出现的证据强调了调节细胞死亡 （RCD） 途径与免疫激活（特别是免疫原性细胞死亡 （ICD））之间至关重要的相互作用。ICD 是指肿瘤细胞死亡并释放损伤相关分子模式（DAMP）和其他信号分子，从而重塑肿瘤免疫微环境（TIME）的一种特定形式的调节性细胞死亡。虽然规范的 RCD 途径已经很成熟，但 ICD 的诱导因子、TIME 动力学的时空调节以及免疫细胞的功能状态仍不完全清楚。我们彻底评估了利用 RCD 驱动的免疫调节作用机制的当代治疗方法，包括增强 ICD 和增强抗肿瘤免疫反应的策略。本综述的新颖之处在于其双重视角：描述肿瘤内在死亡程序如何重新编程肿瘤 TIME，以及免疫细胞死亡如何直接决定其向免疫刺激状态与免疫抑制状态的极化，最终影响治疗结果。我们深入分析了不同形式的 RCD 如何塑造抗原呈递、引导
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2. 重新思考现代肿瘤学试验中的终点——超越 P 值。

• ✍️ 作者：未知作者
• 🏷️ 关键词：肿瘤
• 📝 描述：Secret hovertext:
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3. 重新思考现代肿瘤学试验中的终点——超越 P 值。

• ✍️ 作者：未知作者
• 🏷️ 关键词：肿瘤
• 📝 描述：Secret hovertext:
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1. ⭐ Simplifying Interactions with Complex Widgets in shinytest2 Using JavaScript APIs

• ✍️ 作者：未知作者
• 🏷️ 关键词：scDNA、genome、genomics、epigenetic
• 📝 描述：When shinytest2’s set_inputs() won’t work, leverage widget APIs directly. Learn to write cleaner, faster and more robust tests using JavaScript APIs. Continue reading: Simplifying Interactions with Complex Widgets in shinytest2 Using JavaScript APIs
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